Sub coordonarea Ministerului Învățământului Public și al Uniunii Naționale a Studenților din România se formează astfel echipa de fotbal U.N.S.R. Craiova, care este înscrisă în campionatul județean. Primul meci oficial se dispută la Filiași, pe 5 septembrie 1948, studenții fiind învinși cu 6-3. Echipa de fotbal își schimbă denumirea în CSU Craiova în 1950, și apoi în Știința Craiova (1953) și Univ
ersitatea Craiova (1966).
În 1951, C.S.U. Craiova învinge cu 6-0 echipa locală Constructorul, în primul joc oficial în Cupa României.
În 1954, la turneul de baraj pentru categoria B de la Arad, Știința Craiova, antrenată de Nicolae Oțeleanu, se califică în Divizia B, dar retrogradează în sezonul următor. În anii 1956 – 1958 activează în categoria C. La 6 iulie 1958, Știința Craiova, antrenată de Ionescu Crum, reintră în divizia B, după un joc cu Unirea Râmnicu Vâlcea. În B va evolua până în 1964.
În sezonul 1963/1964, sub conducerea lui Nicolae Oțeleanu, echipa promovează în A.
În ediția 1973/1974, Universitatea câștigă pentru prima dată titlul de campioană a României. Universitatea este prima echipă studențească din țară și din Europa ajunsă campioană națională. Prima Cupă a României vine în Bănie în stagiunea 1976/1977, când Universitatea învinge în finală Steaua, cu 2-1.
În sezonul următor, 1977/1978, echipa Craiovei recidivează în Cupă. De această dată victorie cu 3-1 în fața echipei Olimpia Satu Mare.
În ediția 1979/1980, Universitatea Craiova se încoronează iarăși campioană a României.
În 1981, Universitatea realizează primul event. Cupa și campionatul ajung în Bănie! Mai mult, se califică în turul trei al Cupei Campionilor Europeni, performanță fără precedent în istoria fotbalului românesc.
În 1982, are loc prima calificare a unei echipe românești în sferturile Cupei Campionilor Europeni, iar un an mai târziu, Știința depășește noi limite, devenind prima echipă din România calificată într-o semifinală de cupă europeană, în speță Cupa UEFA. Era vremea în care naționala României se construia pe scheletul Universității, când Maximii nu aveau rival în țară, făcând instrucție cu Steaua, Dinamo și Rapid.
În 1991, CS Universitatea Craiova atinge din nou marile culmi pe plan intern, când se realizează iar eventul.
În 1993, CS Universitatea Craiova câştigă ultima Cupă a României, după ce învinge în finală Dacia Unirea Brăila cu 2-0.
