Il Nunjutsu è composto da uno studio di 36 scuole, i fondamentali nelle Scuole che si studiano sono:
1) Taijutsu: difesa senz'armi. E' la forma più efficace per difendersi da uno o più avversari, perché conta su un sistema completo di calci, pugni, proiezioni, lussazioni, punti di pressione etc..che possono essere utilizzati in eventuali circostanze di estremo pericolo. Al taijutsu sono associate
le seguenti sezioni:tecniche di agilità, acrobatica, coordinazione, potenziamento fisico.
-Koppojutsu: colpi alla struttura ossea.
-kosshijutsu: punti di digitopressione su muscoli o centri nervosi.
-Mutodori: sistema di difesa da e con armi.
2) Rokushaku-bo-jutsu. Questa sezione d'allenamento comprende esercizi con il bastone lungo, il bastone corto, armi da lancio tipiche dei ninja, ed altre particolari armi associate all'antica scuola Hontaikukishin Ryu,
molto conosciuta in Giappone per le sue tecniche di altissimo livello.
3) Esiste un'altra parte fondamentale, di fatto e' la più importante per ogni guerriero aldilà della scuola cui appartiene.Si tratta del
Seishinteki Kyoyo o raffinamento spirituale, le maniere di un essere umano con tutte le virtù. Non possiamo dividere la mente e lo spirito dal corpo, tutti i problemi di queste aree si rifletteranno sul modo di agire del corpo. Questa preparazione spirituale mira ad allenare e rafforzare pazienza, resistenza,onesta' gentilezza, fiducia in se stessi, compassione e bontà, buone maniere e tutti gli aspetti che lodiamo in un essere umano. In Giappone queste caratteristiche sono chiamate Butoku, cioé virtù marziali. il segreto su come sviluppare il Butoku risulta chiaro dall'espressione"kaio waraku" e "kato chikusei" le quali significano"Cuore come un fiore" e "Spirito come il bambu'", questo e' il vero cammino marziale. L'ingresso e le attività dell'Associazione Sportiva Dilettantistica Martial Arts Study Center (no profit) è riservato ai soci.