Fundado el 28 de febrero de 1978, nacido desde la cuna de uno de los sectores más populares de La Concordia, el barrio San Rafael. Iniciativa del señor Ricardo Zambrano Pincay (+) que llegó desde la provincia de Manabí quien formó un equipo de indor futbol cuyos campeonatos se realizaban en el coliseo de la localidad; los colores iniciales del plantel era el verde y blanco con lo que conquistaron
la admiración de los Concordense ya que todos eran muy jóvenes y una particularidad fue que sus integrantes pertenecían a la familia Zambrano. Con este antecedente se pensó en participar en el campeonato de futbol local, allí utilizó una nueva indumentaria, los colores utilizados eran el amarillo y negro contando con el auspicio de Gasolinera Amazonas, de igual forma sus integrantes eran familiares y vecinos de los barrios muy jóvenes por cierto. Los logros no se hicieron esperar, por tal razón en la siguiente edición ya se consagró como campeón el Club San Rafael y sin detenerse logró el palmarés que detallamos:
· 13 campeonatos barriales
· 15 vice campeonatos barriales
· 4 veces bicampeones (1 bicampeonato invicto)
· 1 campeonato provincial (cuando pertenecíamos a Esmeraldas)
· 1 campeonato Cantonal
- 1 vicecampeonato profesional
- 1 campeonato profesional 2017
- 1 campeonato profesional 2018
- 1 vice campeonato profesional 2019
