No ano de 1979, um grupo de amigos dissidentes do Doizão Futebol Clube (Rogério, Teco e João Bilola) e do Clube de Regatas Guará (Pavão, Perla, Mondongra e Cabecinha) resolveram se reunir, na cidade do Guará, Distrito Federal, para fundar o Clube Social Esportivo Maringá. A data oficial da fundação do clube é dia 15 de janeiro de 1980. Na época, as seleções do Uruguai e Argentina atravessavam grandes fases, e em homenagem a elas se deu a escolha das cores azul, preto e branco. Em virtude também do grande destaque nacional naquela época da equipe do Maringá, do estado do Paraná, é que se deu a escolha do nome. Hexacampeão do Campeonato Amador de Brasília, organizado pela Federação Brasiliense de Futebol; e Campeão da Copa dos Campeões de Brasília, em 1998, o Clube Social Esportivo Maringá se profissionalizou em 2004, e participou do Campeonato Brasiliense de Futebol Profissional da Segunda Divisão do mesmo ano. Em 5 de julho de 2005, a partir das instalações e estrutura do Clube Social Esportivo Maringá, foi fundado o Capital Clube de Futebol Ltda. na cidade do Guará, Distrito Federal. Em 2005, logo no primeiro ano de participação do clube no Campeonato Brasiliense da Segunda Divisão, o "Corujão do Guará", como é popularmente conhecida, se sagrou campeão, conquistando o acesso automático ao Campeonato Brasiliense da Primeira Divisão 2006. Em 2006, na primeira participação na Primeira Divisão local, o Capital amargou o rebaixamento da competição, ao terminar em 9º lugar entre 10 participantes. Em 2007, de volta ao Campeonato Brasiliense da Segunda Divisão, amargou o 2º rebaixamento consecutivo, chegando a Terceira Divisão do futebol local. Em 2009, o clube se sagrou campeão do Campeonato Brasiliense da Terceira Divisão, e conquistou o acesso automático para o Campeonato Brasiliense da Segunda Divisão de 2010. Em agosto de 2011, firmou uma parceria com o Cristalina Atlético Clube de Goiás, passando a se chamar "Capital/Cristalina". Entretanto a parceria durou apenas no ano de 2011, em 2012 o time retornou ao Guará. Ascendeu à primeira divisão metropolitana de 2012 após terminar o Campeonato Brasiliense de Futebol da Segunda Divisão de 2011 em 5° lugar, devido à mudança na fórmula de disputa da divisão principal, que passou de 8 para 12 participantes. Em 2012 disputa pela segunda vez a Primeira Divisão do Campeonato Brasiliense, terminando na sétima colocação. No Campeonato Brasiliense de 2013 a equipe termina novamente em sétimo. No campeonato de 2014 a equipe termina em décimo primeiro e é rebaixada para a Segunda Divisão. Em 2015 termina em décimo e permanece na Segunda Divisão. Em 2016 se licencia e não disputa o campeonato. Em 2017 a equipe não estava incluída na competição, porém após uma liminar na justiça a equipe conseguiu ser incluída na competição. Compondo uma parceria com o Clube Desportivo Futebol Universidade de Brasília, disputa o Campeonato Brasiliense da Segunda Divisão e termina em 8º lugar geral, com uma comissão técnica e grupo de atletas formados somente por universitários, predominantemente da Universidade de Brasília.
