26/08/2024
Sa carrière d'entraîneur a débuté au sein du club belge Berchem Sport , qu'il a mené au championnat de quatrième et troisième divisions belges. Après ce succès, Brys a pris la tête du club de première division Germinal Beerschot .
Lors de sa première année, avec le plus petit budget de compétition, Germinal a terminé 7e, alors que 75 % des entraîneurs belges prédisaient que le club serait relégué. En mai 2005, lors de sa deuxième année, Brys a emmené Germinal à une victoire 2-1 contre le Club Bruges en Coupe de Belgique , le premier et seul prix que Germinal remporterait dans son histoire. Germinal a participé à la Coupe UEFA 2005-2006 mais a été éliminé par l'Olympique de Marseille aux tirs au but.
En 2006-2007, Brys devient entraîneur du Royal Mouscron-Péruwelz , club dont il est licencié malgré une septième place. Il entraîne ensuite les FC Eindhoven et Den Bosch aux Pays-Bas .
En 2010, Brys signe pour deux ans au KV Mechelen . Au cours de sa première année, le club atteint le total de points le plus élevé de son histoire.
En 2012, Brys a dirigé le club saoudien Al-Faisaly FC (Harmah) . Il a atteint les demi-finales de la Crown Prince Cup et est devenu vainqueur de groupe de la Gulf Cup . Lors de sa deuxième saison, il a cependant été licencié et a pris la tête du Club Al-Raed pour les quatre derniers matchs de la compétition. Il a réussi à les maintenir en First League avec deux victoires et deux nuls.
Après un passage de plus de trois saisons, Brys a finalement été limogé à l'OH Leuven en octobre 2023 et a pris sa retraite, s'installant avec sa femme dans sa maison en Crète . Six mois plus t**d, cependant, Brys a signé pour le Cameroun , suivant les traces de son compatriote belge Hugo Broos qui avait déjà dirigé l'équipe en 2016 et 2017. Brys a également déclaré avoir refusé des offres d'autres nations africaines telles que le Ghana et la Tunisie .